1.纤维结肠镜检 诊断上主要依靠结肠镜检，因为90%～95%患者直肠和乙状结肠受累。镜检中早期病变可见肠黏膜有多发性糜烂或浅表性溃疡，可看到充血、水肿的黏膜，脆而易出血。在进展性病例中可看到溃疡，周围有隆起的肉芽组织和水肿的黏膜，貌似息肉样，或可称为假息肉形成。在慢性进展性病例中直肠和乙状结肠腔可明显缩小，为明确病变范围，目前常用结肠镜作全结肠检查，同时作多处活组织检查以便与克罗恩病性结肠炎鉴别，组织活检病理诊断是慢性结肠炎的“金标准”。
2.气钡灌肠双重对比造影 在钡灌造影中可见到结肠袋消失，肠壁不规则，假息肉形成以及肠腔变细、僵直。有腹部征象的病例忌作钡剂灌肠检查，而应作腹部X线平片检查，观察有无中毒性巨结肠、结肠扩张以及膈下游离气体征象。
3.粪便检查 大便常规见红、白细胞及少量脓细胞，检测粪毒素，并进行需氧菌和厌氧菌的培养，便培养无痢疾杆菌及阿米巴原虫，若能找到致病菌，是慢性结肠炎诊断的重要依据之一。
4.血液生化检查 可见电解质紊乱，常有低钾、低钠及低蛋白血症，血清蛋白可低于30g/L，白细胞计数可高达2万以上，且以中性细胞为主。
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